Od 24 listopada 2007 r. Joanna Agacka-Indecka pełniła funkcję prezesa Naczelnej Rady Adwokackiej. W 2010 r. weszła w skład Komisji Kodyfikacyjnej Prawa Karnego działającej przy Ministerstwie Sprawiedliwości.
Zginęła 10 kwietnia 2010 r. w katastrofie polskiego samolotu Tu-154M pod Smoleńskiem, w drodze na obchody 70. rocznicy zbrodni katyńskiej, a 19 kwietnia została pochowana na Starym Cmentarzu w Łodzi. Jej imieniem nazwano plac przed Sądem Apelacyjnym i Okręgowym w Łodzi. Joanna Agacka-Indecka (ur. 1964 r.) całe życie związana była z Łodzią. Ukończyła prawo na Uniwersytecie Łódzkim w 1988 r. i została pracownikiem naukowym tej uczelni.
Do katastrofy doszło 10 kwietnia 2010 roku o godz. 8.41. Zginęło w niej 96 osób. Wśród nich byli m.in. prezydent Lech Kaczyński z małżonką, ostatni prezydent RP na uchodźstwie Ryszard Kaczorowski,18 parlamentarzystów, dowódcy rodzajów sił zbrojnych WP oraz liczni przedstawiciele ministerstw i duchowieństwa.
Była to druga pod względem liczby ofiar katastrofa w historii polskiego lotnictwa.
Pod pomnikiem smoleńskim na pl. Katedralnym kwiaty złożył i znicz zapalił Pełnomocnik Prezydent ds. Dziedzictwa Łodzi Mariusz Goss.